Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdgfaP20033 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms