Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox5bP19536 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox5bP19536 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms