Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl13aP19253 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms