Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18532 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18532 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18532 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18532 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18532 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18532 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18532 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18532 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18532 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18532 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18532 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P18532 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18532 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18532 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18532 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18532 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18532 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18532 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18532 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18532 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P18532 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms