Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pou4f1P17208 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms