Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkceP16054 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms