Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp53P15975 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp53P15975 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp53P15975 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp53P15975 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp53P15975 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms