Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rag1P15919 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rag1P15919 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rag1P15919 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms