Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Dnmt1P13864 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms