Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms