Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtcP11725 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtcP11725 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtcP11725 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtcP11725 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtcP11725 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtcP11725 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtcP11725 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtcP11725 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtcP11725 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtcP11725 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtcP11725 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtcP11725 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OtcP11725 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OtcP11725 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OtcP11725 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OtcP11725 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtcP11725 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms