Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga5P11688 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itga5P11688 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.3 ms