Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DmdP11531 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DmdP11531 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DmdP11531 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DmdP11531 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DmdP11531 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DmdP11531 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DmdP11531 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DmdP11531 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DmdP11531 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DmdP11531 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DmdP11531 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DmdP11531 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DmdP11531 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DmdP11531 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DmdP11531 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DmdP11531 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DmdP11531 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DmdP11531 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DmdP11531 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DmdP11531 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DmdP11531 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DmdP11531 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DmdP11531 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DmdP11531 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DmdP11531 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DmdP11531 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DmdP11531 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DmdP11531 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DmdP11531 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DmdP11531 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DmdP11531 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DmdP11531 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DmdP11531 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
DmdP11531 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DmdP11531 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DmdP11531 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DmdP11531 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms