Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spp1P10923 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spp1P10923 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spp1P10923 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms