Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms