Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nid1P10493 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms