Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P10404 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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P10404 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P10404 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P10404 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P10404 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms