Protein–RNA interactions for Protein: P0DP27

Calm2, Calmodulin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm2P0DP27 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calm2P0DP27 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calm2P0DP27 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms