Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms