Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amd1P0DMN7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms