Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeflP08551 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeflP08551 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeflP08551 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeflP08551 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeflP08551 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeflP08551 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeflP08551 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeflP08551 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeflP08551 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeflP08551 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeflP08551 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeflP08551 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeflP08551 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeflP08551 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeflP08551 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeflP08551 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeflP08551 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeflP08551 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeflP08551 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeflP08551 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeflP08551 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeflP08551 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeflP08551 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeflP08551 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeflP08551 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeflP08551 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeflP08551 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeflP08551 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeflP08551 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeflP08551 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeflP08551 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeflP08551 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeflP08551 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeflP08551 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeflP08551 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeflP08551 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeflP08551 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeflP08551 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeflP08551 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeflP08551 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeflP08551 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeflP08551 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeflP08551 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeflP08551 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeflP08551 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeflP08551 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeflP08551 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeflP08551 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeflP08551 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeflP08551 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeflP08551 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeflP08551 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeflP08551 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NeflP08551 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NeflP08551 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NeflP08551 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NeflP08551 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NeflP08551 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NeflP08551 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NeflP08551 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NeflP08551 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms