Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gap43P06837 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gap43P06837 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms