Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TnfP06804 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnfP06804 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnfP06804 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TnfP06804 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TnfP06804 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TnfP06804 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TnfP06804 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TnfP06804 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnfP06804 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnfP06804 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnfP06804 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnfP06804 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnfP06804 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnfP06804 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnfP06804 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnfP06804 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnfP06804 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnfP06804 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnfP06804 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnfP06804 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnfP06804 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TnfP06804 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TnfP06804 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TnfP06804 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TnfP06804 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TnfP06804 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TnfP06804 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TnfP06804 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TnfP06804 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TnfP06804 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TnfP06804 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TnfP06804 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TnfP06804 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TnfP06804 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TnfP06804 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TnfP06804 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnfP06804 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnfP06804 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms