Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgamP05555 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgamP05555 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ItgamP05555 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgamP05555 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgamP05555 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms