Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tk1P04184 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tk1P04184 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms