Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt1P04104 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms