Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01735 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01735 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01735 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01735 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01735 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01735 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01735 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01735 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01735 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01735 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01735 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01735 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01735 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01735 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01735 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01735 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P01735 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01735 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01735 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01735 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01735 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01735 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01735 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01735 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01735 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01735 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01735 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01735 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms