Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01673 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01673 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01673 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01673 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01673 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01673 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01673 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01673 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01673 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01673 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01673 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01673 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01673 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms