Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01672 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01672 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01672 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01672 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01672 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01672 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01672 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01672 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01672 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01672 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01672 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01672 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01672 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01672 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01672 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01672 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01672 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01672 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01672 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01672 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
P01672 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01672 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01672 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01672 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01672 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01672 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01672 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01672 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01672 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01672 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01672 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01672 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01672 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01672 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01672 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01672 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01672 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01672 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01672 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01672 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01672 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01672 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01672 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01672 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01672 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01672 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
P01672 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01672 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01672 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01672 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms