Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01665 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01665 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01665 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01665 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01665 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01665 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01665 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01665 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01665 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01665 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01665 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01665 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01665 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01665 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01665 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01665 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01665 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01665 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01665 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01665 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01665 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01665 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01665 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01665 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01665 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01665 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01665 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01665 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01665 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01665 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01665 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01665 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms