Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01649 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01649 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01649 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01649 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01649 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01649 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01649 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01649 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01649 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01649 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01649 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01649 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01649 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01649 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01649 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01649 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01649 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01649 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01649 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01649 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01649 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01649 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01649 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01649 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01649 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01649 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01649 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01649 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms