Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnb1P01575 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms