Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl20O89093 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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