Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo1O89026 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Robo1O89026 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms