Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MscO88940 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MscO88940 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MscO88940 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MscO88940 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MscO88940 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MscO88940 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MscO88940 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms