Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CntfrO88507 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CntfrO88507 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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