Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkcO88445 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AurkcO88445 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms