Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl22O88430 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl22O88430 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms