Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt1O88346 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt1O88346 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms