Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col5a1O88207 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col5a1O88207 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms