Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn4O70507 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms