Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxq1O70220 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxq1O70220 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms