Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms