Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms