Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LatO54957 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LatO54957 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LatO54957 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LatO54957 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LatO54957 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LatO54957 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LatO54957 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LatO54957 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LatO54957 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LatO54957 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LatO54957 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LatO54957 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LatO54957 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LatO54957 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LatO54957 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LatO54957 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms