Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole2O54956 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms