Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csnk2a2O54833 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms