Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnnO35691 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnnO35691 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnnO35691 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnnO35691 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnnO35691 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnnO35691 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PnnO35691 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnnO35691 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnnO35691 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnnO35691 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnnO35691 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnnO35691 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnnO35691 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnnO35691 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnnO35691 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnnO35691 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PnnO35691 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PnnO35691 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PnnO35691 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnnO35691 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms