Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms