Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-ObO35424 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms